Gate 21’s formål er at iværksætte erhvervsudviklingsaktiviteter inden for innovation, videndeling og videnopbygning samt anvendelse af ny teknologi inden for områderne klima, energi og miljø. Aktiviteterne omfatter blandt andet etablering af innovationsmiljøer, samarbejde og netværk mellem private virksomheder, offentlige myndigheder og forsknings- og uddannelsesinstitutioner inden for områderne klima, energi og miljø. 

Foreningen ledes af en bestyrelse på op til 15 medlemmer, som vælges på følgende måde: 

• Seks medlemmer udpeges af Gate 21’s borgmesterforum. Udpegning af de seks kommunale bestyrelsesmedlemmer sker for to år ad gangen, dog således forskudt, at tre medlemmer vælges hvert år på Borgmesterforums årsmøde. 
• To regionale medlemmer udpeges af de regionale medlemmer. 
• Seks medlemmer vælges på Gate 21’s ordinære generalforsamling af og blandt de ikke- kommunale/ikke-regionale partnere. Der vælges tre fra det private erhvervsliv og tre fra uddannelses-/forskningsinstitut. 
• Et medlem kan udpeges umiddelbart efter den ordinære generalforsamling af den nyvalgte bestyrelse. 

Gate 21’s borgmesterforum består af borgmestrene eller et andet medlem af Kommunalbestyrelsen fra Gate 21’s kommunale partnere, dels regionsrådsformændene eller et andet medlem af regionsrådet fra gate 21's regionale partnere. Borgmesterforum har til opgave at rådgive bestyrelsen om politiske prioriteringer i relation til den strategiske udvikling af Gate 21, kommende indsatsområder, strategiske samarbejdspartnere mv.